Skip to main content

Table 3 Description of all genetic (VAF) variables and cytogenetic abnormalities. The percentage of mutations (value > 0) of each variable is presented

From: Identification of relevant features using SEQENS to improve supervised machine learning models predicting AML treatment outcome

 

% mut.

Mean

Std

 

% mut.

Mean

Std

TET2

24.77

0.10

0.20

EPOR

3.04

0.02

0.08

NF1

6.78

0.05

0.16

ETV6

1.87

0.01

0.07

KMT2A

5.37

0.03

0.15

KDM6A

3.50

0.02

0.10

EZH2

5.37

0.03

0.15

PHF6

2.34

0.01

0.09

JAK2

11.92

0.03

0.11

PRPF40B

0.47

0.00

0.03

CBL

6.07

0.02

0.08

SETBP1

0.93

0.01

0.05

SRSF2

10.75

0.05

0.15

SF3A1

2.57

0.01

0.04

KIT

10.28

0.02

0.08

SMC1A

0.08

0.00

0.04

SF3B1

5.14

0.02

0.09

U2AF1

2.10

0.01

0.08

TP53

23.13

0.12

0.26

VHL

1.40

0.01

0.07

DNMT3A

23.13

0.10

0.19

CALR

0.16

0.00

0.03

ASXL1

9.81

0.04

0.13

MPL

0.62

0.00

0.04

IDH1

18.69

0.06

0.13

SH2B3

0.08

0.00

0.03

KRAS

9.81

0.02

0.07

FLT3_ITK

10.05

0.16

0.37

NRAS

19.86

0.05

0.12

FLT3_ITD

10.51

0.06

0.22

NPM1

14.02

0.05

0.14

−7/7q

9.58

0.11

0.32

IDH2

11.68

0.05

0.14

−17/17p

7.01

0.08

0.28

ZRSR2

2.34

0.02

0.14

−5/5q

12.38

0.15

0.36

RUNX1

16.12

0.08

0.20

t(8;21)

1.64

0.02

0.14

FLT3

23.36

0.06

0.14

inv(16)/t(16;16)

4.67

0.06

0.23

BCOR

0.55

0.05

0.19